Khu dự trữ chứa phần diện tích còn sót lại lớn nhất những cánh rừng mưa nhiệt đới ở Honduras và là một trong số ít còn lại ở Trung Mỹ, với nhiều loài đang bị đe dọa.[4] Mặc dù có một số lượng ngày càng tăng những nghiên cứu về sự đa dạng sinh học trong khu bảo tồn, các kế hoạch quản lý hiện nay nhấn mạnh sự cần thiết phải nghiên cứu thêm về hệ thực vật và động vật trong khu vực.

Thực vật

Các hệ sinh thái quan trọng bao gồm rừng ngập mặn, đầm lầy nước ngọt, đồng cỏ cói, thông thảo nguyên, rừng phòng hộ và các khu rừng mưa nhiệt đới. Có một số lượng đa dạng của hệ thực vật, ước tính khoảng hơn 2.000 loài thực vật có mạch,[2] mặc dù số loài biết đến vẫn ít nhưng người ta tin rừng có nhiều loài mới chưa được khám phá có mặt tại đây.[6]

Có hai hệ sinh thái rừng ngập mặn lớn dọc theo bờ biển là Đầm phá Brus và Iban. Khu vực đầm phá Brus có diện tích 120 km ² là khu vực nước lợ và khu vực đầm phá Iban có diện tích 63 km ² là khu vực đầm phá nước ngọt.[6] Rừng ngập mặn có giá trị và dễ bị hủy hoại, vì vậy nó là một phần quan trọng của các giá trị bảo tồn tại đây.

Hơn nữa trong khu vực đất nội địa của khu bảo tồn bao gồm các đồng cỏ cói và thảo nguyên, phụ thuộc vào nguồn nước sẵn có. Dọc theo lưu vực các con sông, thảm thực vật là rừng ẩm ướt dày, tuy nhiên việc nghiên cứu tại đây còn hạn chế.[2]

Động vật

Các loài động vật ghi nhận trong khu vực bao gồm 39 loài động vật có vú, 377 loài chim và 126 loài bò sát và lưỡng cư.[2] Khu vực này là phong phú với các loài chim, trong đó có kền kền vua, đại bàng Harpy, Crax rubra, Chim cổ mào, Vẹt hồng, vẹt đuôi dài và Vẹt xanh lá

Các loài đại diện cho linh trưởng và động vật có vú bao gồm Khỉ mũ trắng, Khỉ rú và Khỉ nhện, Lười cổ nâu, Paca, Kinkajou, Coati, Rái cá Trung Mỹ, Báo sư tử, lợn lòi Pecari, lợn lòi Pecari môi trắng và hươu đỏ.

Các loài quý hiếm đang bị đe dọa bao gồm thú ăn kiến khổng lồ, báo đốm Mỹ, mèo rừng, Mèo đốm Margay, Lợn biển Tây Ấn, và heo vòi Trung Mỹ. Do môi trường giáo dục ở Honduras, vì vậy rất khó để bảo vệ các loài đang bị đe dọa.[7] Ngoài ra, cái nghèo lan rộng và thiếu nghiên cứu chính xác về các hệ sinh thái làm cho việc bảo vệ ngày càng khó khăn. Trong khi các chương trình bảo tồn đạt được mục tiêu riêng, nhưng do không có kế hoạch quản lý hay công tác bảo vệ thành công các loài trực tiếp.